Administrátor (pouze ve verzi e-účet business a vyšší) jeho úkolem je spravovat uživatelské přístupy, zakládat (nebo rušit) uživatele a přiřazovat jim plátce (faktury), které mají oprávnění vidět. Při založení služby e-účet je definován hlavní administrátor – ten má možnost vedle uživatelů zakládat také další administrátory.

Uživatel má možnost pracovat s daty, ke kterým má jeho společnost přístup (podle úrovně služby viz. další kapitola) a ke kterým mu přidělil přístup administrátor.